| 鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测 |
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| 引用本文： | 耿立英,张传生,杜立新.鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测[J].遗传,2008,30(8). |
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| 作者姓名： | 耿立英 张传生 杜立新 |
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| 作者单位： | [1]河北科技师范学院生命科学系,昌黎066600 [2]河北科技师范学院动物科学系,昌黎066600 [3]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心,北京100193 |
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| 基金项目： | 河北科技师范学院博士启动基金，河北省自然科学基金 |
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| 摘 要： | GDF-8、IGF-I,IGF-III、IGF2R、,IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因.利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3'UTR潜在的microRNA靶标,并发掘靶标区域SNP位点.结果表明:在6个基因的26个microRNA靶标区域,共检测到125个SNP位点,在靶标及其5'和3'邻接等长侧翼区分别检测到47个,44个和35个SNPs位点,其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区.种子序列互补区及其3'侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控,导致家禽的表型变异.
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| 关 键 词： | 鸡 非翻译区 小RNA 生物信息学 单核苷酸多态性 |
Identification of SNPs located in putative microRNA target region of six functional genes in cnickens through bioinformatic analysis |
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| GENG Li-Ying,ZHANG Chuan-Sheng,DU Li-Xin.Identification of SNPs located in putative microRNA target region of six functional genes in cnickens through bioinformatic analysis[J].Hereditas,2008,30(8). |
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| Authors: | GENG Li-Ying ZHANG Chuan-Sheng DU Li-Xin |
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