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木本植物全基因组测序研究进展
作者姓名:施季森  王占军  陈金慧
作者单位:南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室, 南京 210037
基金项目:国家自然科学基金重点项目,国家自然科学基金青年项目,国家林业局,948,引进项目,江苏高校自然科学基金项目,江苏省高校优势学科建设工程项目
摘    要:近年来, 植物全基因组测序的结果正如雨后春笋般涌现, 木本植物全基因组测序也在紧锣密鼓地展开。但由于木本植物通常基因组较大, 基因组结构较为复杂, 在测序、测序后的组装、注释、功能分析等均存在较大的困难。在基因组测序分析的经费预算方面也存在着较大的压力。因此, 有必要对这方面的研究进展及其存在问题进行分析比较, 以提高林木全基因组研究方面的效率。文章在比较分析已经发展起来的3代基因测序技术(Sanger测序法、合成测序法和单分子测序法)的基础上, 选择4种已经公布的木本植物(杨树、葡萄、番木瓜、苹果), 从全基因组测序的研究背景、测序结果及应用的研究进展和存在问题等方面进行了述评, 对未来要开展的木本植物全基因组测序前的准备工作(材料选择、遗传图谱和连锁图谱的构建、测序技术的选择), 全基因组测序结果的生物信息学分析和应用进行了讨论。

关 键 词:木本植物  测序技术  全基因组  
收稿时间:2011-09-07
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