| 本土绵羊品种GH与IGF-1基因多态性分析 |
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| 引用本文： | 丁宁,刘思嘉,田菲,田得红,李雪,赵凯.本土绵羊品种GH与IGF-1基因多态性分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(2):504-515. |
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| 作者姓名： | 丁宁 刘思嘉 田菲 田得红 李雪 赵凯 |
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| 作者单位： | 中国科学院西北高原生物研究所,西宁,810008;中国科学院大学生命科学学院,北京,100049;呼伦贝尔生态产业技术研究院,海拉尔,021000;中国科学院西北高原生物研究所,西宁,810008 |
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| 摘 要： | 生长性状是绵羊育种中关注的重要性状.GH和IGF-1基因已被证明是影响动物生长发育的重要候选基因.因此,了解中国本土绵羊GH和IGF-1基因的遗传多样性,将为提高本土绵羊的生产效率、制定遗传育种和品种改良措施奠定基础.本研究以本土绵羊品种呼伦贝尔羊、藏羊、湖羊、阿勒泰羊、小尾寒羊和滩羊为主要研究对象,以澳白羊为参考,通过Sanger测序检测了340只绵羊GH和IGF-1外显子单核苷酸多态性.研究发现,GH和IGF-1基因外显子区分别检测到11个和3个SNPs,呈品种特异性分布,在群体中处于低度至中度多态.连锁不平衡分析发现,GH基因的SNP1、SNP3、SNP6、SNP7和SNP8呈强连锁不平衡,构建的7种单倍型中,CGACAG是优势单倍型(52.6％),而IGF-1基因的3个SNPs之间连锁关系很弱.生物信息学分析发现,检测到的14个SNPs中GH的SNP2、SNP4、SNP8和IGF-1的SNP1、SNP3为新发现的多态位点,其中SNP4和SNP9为错义突变,可能会导致编码蛋白质二级结构与三级结构发生改变.研究结果表明,与其他本土品种和澳白羊相比,湖羊的GH和IGF-1基因具有较为丰富的遗传变异.已有研究证实GH的SNP6和SNP9以及IGF-1的SNP2不同基因型与绵羊的生长和胴体性状相关联,且在本土品种中均有多态,推测GH基因的SNP6、SNP9和IGF-1基因的SNP2可作为本土绵羊生长性状分子标记辅助选择的候选SNPs.
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| 关 键 词： | 生长激素 胰岛素样生长因子 基因多态性 连锁不平衡 绵羊 |
Polymorphism Analysis of GH and IGF-1 Genes in Native Sheep Breedsroke |
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| Ding Ning,Liu Sijia,Tian Fei,Tian Dehong,Li Xue,Zhao Kai.Polymorphism Analysis of GH and IGF-1 Genes in Native Sheep Breedsroke[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(2):504-515. |
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| Authors: | Ding Ning Liu Sijia Tian Fei Tian Dehong Li Xue Zhao Kai |
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