以雾灵山夜蛾科为材料评估进化模型对DNA条码分类的影响 |
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作者姓名: | 迟美妍 韩辉林 高强 杨聪慧 金倩 李俊 陈付强 武春生 张爱兵 |
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作者单位: | 1. 首都师范大学生命科学学院,北京,100048 2. 东北林业大学林学院,哈尔滨,150000 3. 中国科学院动物研究所动物进化与系统学重点实验室,北京,100101 |
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基金项目: | 北京市自然科学基金重点项目(项目编号:KZ201010028028)北京市人才强教项目(项目编号:PHR201107120)国家自然科学基金项目(项目编号:31071963,31272340,31172129) |
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摘 要: | 为了探究进化模型对DNA条形码分类的影响, 本研究以雾灵山夜蛾科44个种的标本为材料, 获得COI基因序列。使用邻接法(neighbor-joining)、 最大简约法(maximum parsimony)、 最大似然法(maximum likelihood)以及贝叶斯法(Bayesian inference)构建系统发育树, 并且对邻接法的12种模型、 最大似然法的7种模型、 贝叶斯法的2种模型进行模型成功率的评估。结果表明, 邻接法的12种模型成功率相差不大, 较稳定; 最大似然法及贝叶斯法的不同模型成功率存在明显差异, 不稳定; 最大简约法不基于模型, 成功率比较稳定。邻接法及最大似然法共有6种相同的模型, 这6种模型在不同的方法中成功率存在差异。此外, 分子数据中存在单个物种仅有一条序列的情况, 显著降低了模型成功率, 表明在DNA条形码研究中, 每个物种需要有多个样本。
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关 键 词: | 鳞翅目 夜蛾科 COI基因 进化模型 DNA条形码 系统发育树 物种鉴定 |
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