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| 霍乱弧菌分型噬菌体VP3基因组序列的测定与分析 | |
| 作者姓名： | 赵英伟 王多春汪敏 李燕萍阚飙 |
| 作者单位： | 1. 苏州大学基础医学院,苏州,215123;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京,102206 2. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京,102206 3. 国家人类基因组南方研究中心,上海,201203 4. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京,102206;南昌大学中德联合研究院,南昌,330047 5. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京,102206;北京大学医学部,北京,100083 6. 苏州大学基础医学院,苏州,215123 |
| 基金项目： | 国家“973项目”(G1999054102)~~ |
| 摘 要： | 测定和分析霍乱弧菌分型噬菌体VP3基因组序列,并为ElTor型霍乱弧菌两类菌株的分型方法原理提供研究基础。鸟枪法构建VP3噬菌体全基因组随机文库;测序拼接成最小重叠群,引物步移法填补缝隙序列,拼接后获得VP3全基因组序列。PCR随机扩增噬菌体DNA片段并酶切鉴定;预测可能存在的开放读码框(ORF);对VP3和相关噬菌体的DNA聚合酶基因作进化树分析,协助判定VP3的分类;对预测的部分启动子区利用报道基因进行活性分析。VP3全基因组为环状双链DNA,长度39504bp;酶切鉴定结果与序列一致。确定了49个ORF,注释了27个ORF的编码产物,其中有20个基因产物与T7样噬菌体同源,包括RNA聚合酶(RNAP)、参与DNA复制的蛋白、衣壳蛋白、尾管及尾丝蛋白、DNA包装蛋白等。DNA聚合酶(DNAP)进化树分析表明VP3与T7样噬菌体有同源性。将预测的10个启动子序列克隆到lacZ融合质粒pRS1274上,经检测均具有启动子活性。测定和分析VP3的基因组序列,基因组结构与进化树分析提示VP3属于T7噬菌体家族。 |
| 关 键 词： | 霍乱弧菌 噬菌体VP3 基因组 |
| 文章编号： | 0001-6209（2005）06-0851-05 |
| 收稿时间： | 2005-04-18 |
| 修稿时间： | 2005-08-15 |
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