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基于3-D图形表示的DNA序列的相似性分析
引用本文:张玉森,廖波.基于3-D图形表示的DNA序列的相似性分析[J].生物数学学报,2007,22(4):583-590.
作者姓名:张玉森  廖波
作者单位:1. 山东大学,威海分校数学系,山东,威海,264209;中科院,研究生院,北京,100049
2. 中科院,研究生院,北京,100049
摘    要:基于DNA序列的3D图形表示,通过L/L矩阵的规范化最大特征值组成的3维向量来刻画了DNA序列,并基于这种方法,用β-globin基因的第一个外显子分析了11个物种的相似性问题。

关 键 词:相似性  图形表示
文章编号:1001-9626(2007)04-0583-08
收稿时间:2005-09-27
修稿时间:2005年9月27日

On the Similarity of DNA Sequences Based on 3-D Graphical Representation
ZHANG Yu-sen,LIAO Bo.On the Similarity of DNA Sequences Based on 3-D Graphical Representation[J].Journal of Biomathematics,2007,22(4):583-590.
Authors:ZHANG Yu-sen  LIAO Bo
Abstract:Recently, we proposed a 3-D graphical representation of DNA sequences. Based on this representation, we outline one such approach by constructing a 3-component vector whose components are the normalized leading eigenvalues of the L/L matrices associated with DNA. The examination of similarities/dissimilarities among the coding sequences of the first exon of β-globin gene of different species illustrates the utility of the approach.
Keywords:DNA  DNA  Similarity  Graphical representation
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