tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制 |
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作者姓名: | 黄炯杰 陈乐意 廖奇 |
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作者单位: | 宁波大学医学院预防医学系, 浙江省病理生理重点实验室, 浙江, 宁波 315211 |
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基金项目: | 浙江省自然科学基金(No.LY21C060002); 浙江省属高校基本科研业务费(No.SJLZ2021001); 国家自然科学基金项目(No. 31970630) |
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摘 要: | 随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA。为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等。同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具。大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式。随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物。因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述。
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关 键 词: | tRNA衍生小分子 tRNA衍生片段 数据库 生物信息学鉴定 |
收稿时间: | 2021-02-27 |
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