圆口铜鱼亲本与子代肝脏转录组特征及对比分析 |
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引用本文: | 李学梅,吴兴兵,龚进铃,朱永久,杨德国. 圆口铜鱼亲本与子代肝脏转录组特征及对比分析[J]. 水生生物学报, 2020, 44(4): 774-780. DOI: 10.7541/2020.093 |
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作者姓名: | 李学梅 吴兴兵 龚进铃 朱永久 杨德国 |
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摘 要: | 通过Illumina HiseqTM 2000测序平台首次开展了圆口铜鱼(Coreius guichenoti)亲本与子代肝脏转录组测序并对比分析其测序结果。对转录组进行拼接和组装, 共获得80688个Unigene, Unigene的长度主要分布在401—600 bp, 占总Unigene的43.56%。与Nr、GO、COG、KEGG等公共数据库比对并进行功能注释, 经分析圆口铜鱼亲本与子代差异表达基因共2701个, 其中上调1240个, 下调1461个。差异基因表达模式聚类热图显示, 同一样本不同重复基因表达相似。将差异基因映射到代谢通路KEGG数据库进行富集分析, 并对37个KEGG显著富集的代谢通路(P<0.05)构建其基因共表达网络, 结果显示丙酸盐代谢、丙酮酸代谢、原核生物固碳途径、乙醛和二羧酸代谢、脂肪酸代谢、萜类骨架生物合成是KEGG差异表达基因的核心代谢途径, 且这些基因在圆口铜鱼子代中表达量均显著上调。该结果丰富了圆口铜鱼基因组数据, 并首次从分子水平比较了圆口铜鱼亲本和子代的代谢差异, 同时解释了在同一循环水系统中子代不易患病的现象。
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关 键 词: | 圆口铜鱼 肝脏 转录组 代谢通路网络 |
收稿时间: | 2019-08-23 |
COMPARATIVE ANALYSIS OF LIVER TRANSCRIPTOME OF PARENT AND OFFSPRING COREIUS GUICHENOTI |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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