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一种用于基因芯片可靠的双轮RNA线性扩增技术
引用本文:周荣荣,卫军霞,王亚辉,张亮,程京,周玉祥.一种用于基因芯片可靠的双轮RNA线性扩增技术[J].中国生物化学与分子生物学报,2006,22(6):498-507.
作者姓名:周荣荣  卫军霞  王亚辉  张亮  程京  周玉祥
作者单位:1. 清华大学生物科学与技术系,北京,100084
2. 生物芯片北京国家工程研究中心,北京,102206
3. 清华大学生物科学与技术系,北京,100084;生物芯片北京国家工程研究中心,北京,102206;清华大学医学院,北京,100084
基金项目:高比容电子铝箔的研究开发与应用项目;国家高技术研究发展计划(863计划)
摘    要:DNA微阵列能在一次实验中检测成千上万个基因的表达情况, 有助于阐明疾病发生的分子机制及发现新的诊治靶标.但常规方法需要大量RNA, 因而基于T7 RNA线性扩增技术逐渐成为微阵列表达谱实验中最常用的探针制备方法.本方法将实验步骤进一步改进,增加额外的一轮体外转录,并结合Klenow酶标记技术来制备cDNA靶标和寡核苷酸芯片杂交.从纳克量级的总RNA起始,本方法和常规的RNA单轮线性扩增法相比,仍然准确地保留了约70%的基因表达信息.同一RNA样本的自身比较实验及重复实验结果也显示,该方法具有较高的可靠性和重复性.RNA双轮体外扩增法需要的起始RNA相对于常规的单轮扩增法减少了很多(10 ng甚至更少),因而非常适合分析那些只能提供微量RNA的样本.

关 键 词:DNA微阵列  双轮RNA线性扩增  双轮体外转录  可靠性和重复性  
收稿时间:2005-07-19
修稿时间:2005年7月19日

Optimization of Two-cycle T7-based RNA Amplification System for Oligonucleotide DNA Microarray
ZHOU Rong-Rong,WEI Jun-Xia,WANG Ya-Hui,ZHANG Liang,CHENG Jing,ZHOU Yu-Xiang.Optimization of Two-cycle T7-based RNA Amplification System for Oligonucleotide DNA Microarray[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2006,22(6):498-507.
Authors:ZHOU Rong-Rong  WEI Jun-Xia  WANG Ya-Hui  ZHANG Liang  CHENG Jing  ZHOU Yu-Xiang
Institution:ZHOU Rong-Rong1), WEI Jun-Xia2),WANG Ya-Hui2), ZHANG Liang2), CHENG Jing1),2),3),ZHOU Yu-Xiang1),2),3)*
Abstract:
Keywords:
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