| 齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 蔡 明,高 贝,张道远.齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析[J].生物信息学,2013,11(3):216-223. |
| |
| 作者姓名： | 蔡 明 高 贝 张道远 |
| |
| 作者单位： | [1]中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,新疆乌鲁木齐830011 [2]中国科学院大学,北京100049 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（U1170304）. |
| |
| 摘 要： | 用电子克隆方法获得耐旱苔藓齿肋赤藓的热激蛋白60基因，采用生物信息学方法，对该基因编码蛋白从氨基酸组成、结构保守域、理化性质、信号肽、疏水性／亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、二级结构、功能域、活性位点、及同源性等方面进行了预测和分析。结果表明：齿肋赤藓热激蛋白60基因全长1841bp，开放阅读框1581bp，编码526个氨基酸残基；编码蛋白含有GroEL保守域，是chaperon-like superfamily家族；亚细胞定位分析显示，编码蛋白位于内质网中；活性化位点分析表明，编码蛋白存在6类活性位点；同源性分析表明，齿肋赤藓热激蛋白60与小立碗藓预测的HSP60同源性最高，达到92％，与卷柏的HSP60次之，同源性达88．83％。研究结果为该基因的实验克隆奠定基础。
|
| 关 键 词： | 齿肋赤藓 热激蛋白60 电子克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2013/1/31 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/4/17 0:00:00 |
Electronic cloning and characterization of HSP60gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool |
| |
| CAI Ming,GAO Bei and ZHANG Dao-yuan.Electronic cloning and characterization of HSP60gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J].China Journal of Bioinformation,2013,11(3):216-223. |
| |
| Authors: | CAI Ming GAO Bei and ZHANG Dao-yuan |
| |
| Institution: | 1. Key Laboratory of Biogeography and Bioresources in Arid Land, Xinjiang Institute of Ecology and Geography, Chinese Academy of Sciences, Urumqi 830011, China ;2. University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Syntrichia Caninervis Heat Shock Protein 60 （HSP60） In Silico Cloning Bioinformatics |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《生物信息学》下载免费的PDF全文 |
