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地黄C3H基因的克隆及生物信息学分析
作者姓名:周延清  邵露营  郭萌萌  朱佳琳
作者单位:河南师范大学 生命科学学院, 河南 新乡 453000
基金项目:国家级项目培育基金(2016PL11); 河南省自然科学基金(182300410018); 校内结余项目(5201049170556)[Supported by the National Project Cultivation Fund Project(2016PL11); Natural Science Foundation of Henan Province(182300410018); Campus Balance Project(5201049170556)]。
摘    要:香豆酸-3-羟化酶属于植物中最大的蛋白酶细胞色素P450家族之一,在植物生命活动中发挥着重要作用。为了解地黄香豆酸-3-羟化酶基因RgC3H合成毛蕊花糖苷的功能,该研究基于地黄代谢组学分析获得KEGG途径中的C3H,采用多重比对在NCBI中获得同源基因的一个保守序列,并基于该保守序列和地黄SRA数据库,采用电子克隆和RT-PCR克隆技术获得地黄C3H基因全长CDS(RgC3H),对其进行生物信息学分析。结果表明:RgC3H基因全长为1 530 bp,且编码一个含509个氨基酸、分子量为57.91 kD、无信号肽的蛋白质; 基于氨基酸序列的结构分析显示,RgC3H有一个保守区域-P450结构域; 系统进化分析结果显示,RgC3H与芝麻和猴面花的C3H基因具有很高的同源性。上述结果为进一步研究RgC3H基因在地黄毛蕊花糖苷生物合成途径中的作用奠定了基础。

关 键 词:地黄   C3H基因   基因克隆   生物信息学分析
收稿时间:2019-07-26
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