宏基因组学分析揭示深古菌Bathyarchaeota B242的代谢特征 |
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作者姓名: | 冯晓远 Venki Perumal 王风平 |
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作者单位: | 1. 上海交通大学生命科学技术学院 上海 200240; 2. 上海交通大学微生物代谢国家重点实验室 上海 200240,1. 上海交通大学生命科学技术学院 上海 200240; 2. 上海交通大学微生物代谢国家重点实验室 上海 200240,1. 上海交通大学生命科学技术学院 上海 200240; 2. 上海交通大学微生物代谢国家重点实验室 上海 200240; 3. 上海交通大学海洋工程国家重点实验室 上海 200240 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(41525011,91228201,91428308) |
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摘 要: | 【背景】海洋沉积物中蕴含着丰富的微生物资源,估算约2.9×1029个细胞,与海水中的微生物总量相当。但是由于缺少可培养物,大部分的微生物缺乏生理特征、代谢方式以及生态功能的相关研究。深古菌(Bathyarchaeota)是一类典型的未培养微生物,在全球海洋沉积物中普遍存在,并且具有很高的丰度。【目的】对深古菌代谢潜能及其在海洋沉积物中发挥的生态功能进行更加深入的研究。【方法】应用宏基因组学的技术手段,对采集自瓜伊马斯盆地的深海热液沉积物样本进行了分析,获得了一个接近完整的深古菌基因组Bathyarchaeota B242。【结果】对Bathyarchaeota B242基因组的分析发现,其具有以降解蛋白质和多种碳水化合物为主的异养代谢途径,同时还具有通过还原型乙酰辅酶A途径实现的自养途径。【结论】同时具有自养和异养代谢途径对Bathyarchaeota B242适应低物质能量供给环境下的生存起到重要作用。
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关 键 词: | 海洋沉积物 深古菌 宏基因组 蛋白质降解 WL自养途径 |
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