| 东方肉座菌EU7-22木聚糖酶和木糖苷酶基因克隆及生物信息学研究 |
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| 引用本文： | 龙传南,蒋凤姣,邬小兵,刘健,龙敏南.东方肉座菌EU7-22木聚糖酶和木糖苷酶基因克隆及生物信息学研究[J].生物信息学,2013,11(1):58-64. |
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| 作者姓名： | 龙传南 蒋凤姣 邬小兵 刘健 龙敏南 |
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| 作者单位： | 龙传南 (厦门大学能源研究院,福建厦门,361005)；蒋凤姣 (厦门大学能源研究院,福建厦门,361005)； 邬小兵 (厦门大学生命科学学院,福建厦门,361005)；刘健 (厦门大学能源研究院,福建厦门,361005)； 龙敏南 (厦门大学能源研究院,福建厦门361005厦门大学生命科学学院,福建厦门361005)； |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)(项目编号：2010CB732201),中央高校基本科研业务费专项资金(项目编号：201112G026)国家自然科学基金(项目编号：31170067) |
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| 摘 要： | 东方肉座菌EU7-22具有高产半纤维素酶的能力。根据已报道的同属里氏木霉及绿色木霉木聚糖酶,木糖苷酶相关基因序列,设计PCR引物扩增出东方肉座菌内切木聚糖酶(XYNⅠ,XYNⅡ)及β-木糖苷酶(β-BXL)基因。序列经NCBIBlast分析:东方肉座菌xynⅠ基因与里氏木霉xyn1基因(X69573.1)的同源性最高达到91%;xynⅡ基因与绿色木霉xyn2基因(EF079061)同源性最高达到93%;β-bxl基因与里氏木霉β-bxl1基因(Z69257.1)的同源性最高达到94%。生物信息学分析表明内切木聚糖酶Ⅰ和Ⅱ均属于糖基水解酶家族11,N末端前19个氨基酸均为信号肽。内切木聚糖酶Ⅰ分子量为24.13kD,等电点为7.87,含有3个糖基化位点;内切木聚糖酶Ⅱ分子量为24.44kD,等电点为4.86,含有1个糖基化位点;β-木糖苷酶属于糖基水解酶家族3,分子量为87.27kD,等电点为5.49,N末端前20个氨基酸为信号肽,含有8个糖基化位点。利用SWISS-Model对木聚糖酶,木糖苷酶蛋白质三级结构进行了预测和模拟。对木聚糖酶和木糖苷酶基因及其编码蛋白质的生物信息学分析,为进一步研究这些基因的表达与调控、构建高效利用纤维素组份的工程菌株奠定基础。
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| 关 键 词： | 东方肉座菌 木聚糖酶 木糖苷酶 基因克隆 生物信息学 |
| 收稿时间： | 4/9/2011 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 4/9/2012 12:00:00 AM |
Gene cloning and bioinformatics analysis of Xylanases and Xylosidase from Hypocrea orientalis |
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| LONG Chuan-nan,JIANG Feng-jiao,WU Xiao-bing,LIU Jian and LONG Min-nan.Gene cloning and bioinformatics analysis of Xylanases and Xylosidase from Hypocrea orientalis[J].China Journal of Bioinformation,2013,11(1):58-64. |
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| Authors: | LONG Chuan-nan JIANG Feng-jiao WU Xiao-bing LIU Jian and LONG Min-nan |
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| Institution: | 1,2* (1. School of Energy Research, Xiamen University, Xiamen Fujian 361005, China; 2. School of Life Sciences, Xiamen University, Xiamen Fujian 361005, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hypocrea orientalis Xylanases Xylosidase Gene cloning Bioinformatics |
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