痢疾志贺氏菌亚群的比较基因组学研究与进化分析 |
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作者姓名: | 宾文 杨娥 彭俊平张笑冰王璟杨剑董杰楚雍烈张景海金奇 |
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作者单位: | 宾文(沈阳药科大学制药工程学院,沈阳110016;病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
杨娥(西安交通大学医学院,西安710061;病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
彭俊平(病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
张笑冰(病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
王璟(病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
杨剑(病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
董杰(病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176)
楚雍烈(西安交通大学医学院,西安710061)
张景海(沈阳药科大学制药工程学院,沈阳110016)
金奇(病毒基因工程国家重点实验室,北京,100176) |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展规划项目(批准号: G1999054105)、国家高技术研究发展计划项目(批准号: 2001AA223011)及国际科技合作重点项目(批准号: 2001AA223116)资助 |
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摘 要: | 利用大肠杆菌K12 MG1655株全基因组ORFs和痢疾志贺氏菌A1型Sd51197株特异性ORFs探针制备的芯片, 研究了痢疾志贺氏菌13个血清型代表株的基因组组成. 结果显示, 该血清群成员的基因组中包含有2654个保守的源于大肠杆菌ORFs; 共同缺失了219个涉及前噬菌体基因、分子伴侣、特异性O抗原合成等大肠杆菌原有的基因; 并通过水平转移获得了一些特异性基因, 如Ⅱ型分泌系统相关组分、铁转运相关因子等. 根据基因组组成所作的进化树, 发现A1, A2, A8和A10这四型菌与其他痢疾志贺氏菌亲源关系较远. 研究所得结果为进一步深入探索痢疾志贺氏菌的生理过程、致病性和进化奠定了基础.
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关 键 词: | DNA芯片 比较基因组学 痢疾志贺氏菌亚群 |
收稿时间: | 2004-11-10 |
修稿时间: | 2004-11-10 |
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