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肺癌病人肿瘤组织DNA高甲基化片段的筛选
引用本文:刘晋袆,安倩,张建军,雷文东,程书钧,高燕宁.肺癌病人肿瘤组织DNA高甲基化片段的筛选[J].遗传学报,2004,31(4):389-394.
作者姓名:刘晋袆  安倩  张建军  雷文东  程书钧  高燕宁
作者单位:1. 中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所肿瘤医院,北京,100021;第三军医大学军事预防医学院卫生毒理学教研室,重庆,400038
2. 中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所肿瘤医院,北京,100021
基金项目:国家重点基础研究发展规划项目 (编号 :G19980 5 12 0 7),国家科技攻关计划项目 (编号 :2 0 0 2BA711A0 6)资助~~
摘    要:关于DNA甲基化在肿瘤中的作用的研究,大多集中在研究已知的抑癌基因启动子区的异常高甲基化。而一些未知的参与肿瘤发生的基因也可能受甲基化调控,寻找这些与肿瘤相关的基因,对深入了解肿瘤发生的机制具有重要意义。利用甲基化敏感性随机引物PCR(Methyrlation-Sensitive Arbitrarily Primed PCR,MS-AP-PCR),检查了肺癌组织中基因组范围内CpG岛高甲基化情况,分离到8个高甲基化片段(hypermethylated DNA fragment.HMDF)。通过克隆、测序和Blast、NewCpGseek软件分析,发现所有的片段均为典型的CpG岛,有4个片段与人2、7、9、10号染色体上的同源性为99%~100%,但只有1个是已知的基因。进一步利用Neural Network Promoter Prediction、TSSG和TSSW等软件对其余7个片段可能的生物学意义进行了分析,结果有4个片段是候选的启动子区,提示它们可能源于新基因。所获得的高甲基化片段可能是中国人肺癌发生过程中特有的表遗传学改变。

关 键 词:肺癌  DNA甲基化  表遗传学改变  甲基化敏感性随机引物PCR
文章编号:0379-4172(2004)04-0389-06

Screening of Hypermethylated DNA Fragments in Tumor Tissue Derived from Patients with Lung Cancer
LIU Jin-Yi.Screening of Hypermethylated DNA Fragments in Tumor Tissue Derived from Patients with Lung Cancer[J].Journal of Genetics and Genomics,2004,31(4):389-394.
Authors:LIU Jin-Yi
Institution:LIU Jin-Yi~
Abstract:
Keywords:lung cancer  DNA methylation  epigenetic alteration  methylation-sensitive arbitrarily primed PCR
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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