肺腺癌转移相关的免疫特征开发及潜在中药预测 |
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引用本文: | 关双,刘溪,王念,陈亚飞,俞成诚,李兵,刘骏,王忠.肺腺癌转移相关的免疫特征开发及潜在中药预测[J].基因组学与应用生物学,2024(3):548-560. |
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作者姓名: | 关双 刘溪 王念 陈亚飞 俞成诚 李兵 刘骏 王忠 |
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作者单位: | 1. 中国中医科学院中医临床基础医学研究所;2. 中国中医科学院中药研究所 |
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摘 要: | 本研究旨在确定具有免疫相关基因的可靠预后特征,该特征可以预测预后并对肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)患者的个体化管理提供帮助。从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库下载LUAD患者的mRNA表达谱和相应的临床数据;使用单因素COX和LASSO模型来构建预后模型;使用基于风险评分的方法开发预后特征;通过Kaplan-Meier分析比较高风险患者和低风险患者之间的总生存期(overall survival, OS), OS的独立预测因子通过单变量和多变量COX分析确定;单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA)用于评估免疫细胞浸润程度;通过LASSO和COX回归分析构建生存预后特征。根据预后特征,在OS方面将患者显著分层为高风险组和低风险组,与低风险组相比,高风险组的LUAD患者OS显著降低。通过ROC曲线分析证实了预后基因标记的预测能力。多因素COX分析显示,风险评分是OS的独立预测因子。通过免疫分析,发现了肺腺癌转移组与未转移组的不...
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关 键 词: | 肺腺癌 差异表达 预后特征 免疫特征 中药 |
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