白花除虫菊叶绿体基因组特征及系统发育研究 |
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作者姓名: | 吕薇 付瀚森 李伽文 刘科新 柏锦学 王彩云 何杰芳 曾拓 |
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作者单位: | 1. 贵州师范大学生命科学学院;2. 华中农业大学园艺与林业科学学院,教育部园艺植物生物学重点实验室,农业农村部华中都市农业重点实验室;3. 云南南宝生物科技有限责任公司 |
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摘 要: | 白花除虫菊(Tanacetum cinerariifolium)是全球唯一集约化种植的杀虫园艺作物,从其头状花序提取的天然除虫菊酯广泛应用于有机农业和家居害虫防控,具有极高的商业价值。本研究通过Illumina HiSeq 2500测序平台对白花除虫菊叶绿体基因组进行了测序,并对其结构特征及系统进化关系进行了分析。结果表明,白花除虫菊叶绿体基因组为典型的四分体结构,基因组大小为150 171 bp,包括84个蛋白质编码基因、 37个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因;密码子偏好性分析发现其叶绿体基因组中密码子末端偏好以A和U结尾,其中亮氨酸的密码子是最常用的,其使用UUA密码子的频率最高,RSCU值为1.88。在其叶绿体基因组中鉴定到简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)位点共41个,包含37个单核苷酸重复序列、 4个复合型核苷酸重复序列;基于菊科(Asteraceae)39个叶绿体基因组序列构建的系统发育树表明,其叶绿体基因组高度保守,除近缘红花除虫菊(T.coccineum)外,除虫菊类与同为菊科的植物蒿子杆(Ismelia carinata)亲缘...
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关 键 词: | 除虫菊酯 叶绿体基因组 基因组比较分析 系统发育分析 白花除虫菊 |
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