| 刺猎蝽属种间转录组比较分析 |
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| 引用本文： | 邓美菁,赵萍.刺猎蝽属种间转录组比较分析[J].昆虫学报,2023(9):1221-1232. |
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| 作者姓名： | 邓美菁 赵萍 |
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| 作者单位： | 1. 南宁师范大学环境与生命科学学院;2. 南宁师范大学地理与海洋研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32270474)；;广西自然科学基金项目(2021GXNSFAA220106)； |
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| 摘 要： | 【目的】建立刺猎蝽属Sclomina 3种的转录组数据库，分析近缘种间转录组表达差异，探讨在转录组水平的种间趋异情况。【方法】采用Illumina HiSeqTM4000高通量测序平台进行刺猎蝽属齿缘刺猎蝽S.erinacea、兴仁刺猎蝽S.xingrensis和广西刺猎蝽S.guangxiensis 3种转录组测序；利用Nr, Swiss-Prot, COG/KOG和KEGG数据库进行基因功能注释；对种间差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。【结果】齿缘刺猎蝽、兴仁刺猎蝽和广西刺猎蝽转录组测序组装获得42 215个unigenes。21 117个基因在上述4个数据库中得到注释(各数据库注释基因数为：Nr, 20 522; Swiss-Prot, 15 550; COG/KOG, 13 969; KEGG,10 850)。兴仁刺猎蝽vs齿缘刺猎蝽转录组有3 390个DEGs (803个上调，2 587个下调),兴仁刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组有12 543个DEGs (6 63...
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| 关 键 词： | 刺猎蝽属 高通量测序 转录组 差异表达基因 |
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