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球形红假单胞菌反应中心中蛋白的量子化学研究
引用本文:徐红 马淑华 等. 球形红假单胞菌反应中心中蛋白的量子化学研究[J]. Acta Botanica Sinica, 2001, 43(6): 565-570
作者姓名:徐红 马淑华 等
作者单位:中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态与稳态国家重点实验室,北京100080
基金项目:SupportedbytheNationalNaturalScienceFoundationofChina ( 2 973 3 10 0,3 9890 3 90 )andtheStateKeyBasicResearchandDevelopmentPla
摘    要:采用重叠二体近似方法和建立在从算水平上的扩展负本征值因数计算方法(extended negative factor counter method)研究了球形红假单胞菌(Rhodobacter sphaeroides(Van Niel)Imhoff,Truper et Pfennin)中兴合反应中心中蛋白链L及M的电子结构。结果表明:(1)对组成蛋白链L(M)的前线轨道有重要贡献的氨基酸残基分布在L链的自由螺旋区(M链的α螺旋区)。由于自由螺旋是有柔曲性的,它易于在电子转移的过程中改变其构象并降低体系的能量,而α螺旋结构却相对稳定,这种差别有可能是光合反庆中心中电子转移只沿L支进行的原因之一。(2)与特殊对分子及辅助叶绿素分子形成轴向配位的组氨酸残基对于特殊对P和辅助叶绿素分子的ELUMO有重要影响,但此组氨酸的相应分子轨道的贡献并没有出现在蛋白链的前线轨道组成中。这意味着色素分子与蛋白链之间的相互作用对蛋白链前线轨道的贡献没有影响,但却能影响相应色素分子的ELUMO能级。

关 键 词:光合反应中心 球形红假单胞菌 蛋白 电子结构 从头算 扩展负本征值因数计算方法

Quantum Chemical Studies on Proteins in the Reaction Center of Rhodobacter sphaeroides
XU Hong,MA Shu_Hua,SHEN Ling_Ling,ZHANG Xiao_Dong,ZHANG Xing_Kang,ZHANG Qi_Yuan. Quantum Chemical Studies on Proteins in the Reaction Center of Rhodobacter sphaeroides[J]. , 2001, 43(6): 565-570
Authors:XU Hong  MA Shu_Hua  SHEN Ling_Ling  ZHANG Xiao_Dong  ZHANG Xing_Kang  ZHANG Qi_Yuan
Abstract:
Keywords:photosynthetic reaction center  Rhodobacter sphaeroides  electronic structure of protein  ab initio  Extended Negative Factor Counter method (ENFC)
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