| 基于ITS2和16S rRNA的西施舌群体遗传差异分析 |
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| 作者姓名： | 孟学平 申欣 赵娜娜 田美 曾云 陈建安 董志国 程汉良 阎斌伦 |
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| 作者单位： | 淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;南京农业大学资源与环境科学学院, 江苏省海洋生物重点实验室, 南京 210095;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005;淮海工学院海洋学院, 江苏省海洋生物技术重点实验室, 连云港 222005 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金资助项目（BK20131210）;江苏省海洋生物技术重点实验室开放课题资助项目（2011HS009,2009HS13）;国家自然科学基金资助项目（40906067）;江苏省“青蓝工程”人才基金资助项目（苏教师[2010]27号）;中央财政支持地方高校发展专项资金资助项目（CXTD01,CXTD04）;江苏高校优势学科建设工程资助项目;江苏省海洋资源开发研究院科技开放基金资助项目（JSIMR11B19） |
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| 摘 要： | 目前,我国西施舌群体分子遗传差异研究结果存在争议。分析我国南北沿海（9个群体）、与广西北海毗邻的越南（1个群体）西施舌核DNA的内转录间隔区2（ITS2）和线粒体DNA的16S rRNA基因（16S）片段核苷酸序列及其二级结构,为解决争议问题提供分子生物学资料。扩增获得西施舌ITS2片段和16S序列,其长度分别为389-402 bp和306 bp,加之下载序列共147条;序列分析显示,74个ITS2序列共有17种基因型,73个16S序列有15种单倍型,其中,长乐（CL）群体独享9种ITS2基因型和5种16S单倍型,非长乐群体（nCL）多数为群体间交叉共享1种或几种基因（单倍）型;基因（单倍）型核苷酸变异位点占5.7%（ITS2）和11.8%（16S）;基于ITS2和16S的CL群体和nCL群体间的遗传距离与群体内遗传距离之比分别为2.42和11.08,nCL群体间的平均遗传距离均为0.007;二级结构显示CL群体ITS2的9种基因型和16S的5种单倍型均区别于nCL群体,nCL的ITS2和16S二级结构分别相似;ITS2和16S基因的系统发育分析显示,CL西施舌形成支持率很高（98,96）的单系支,而nCL群体则交叉聚为另一支（98,96）。研究结果揭示,福建西施舌是腔蛤蜊属（Coelomactra）的一个新种。
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| 关 键 词： | 西施舌 群体 ITS1 16S rRNA 遗传差异 二级结构 |
| 收稿时间： | 2012-09-04 |
| 修稿时间： | 2013-02-27 |
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