| 猪内源性反转录病毒5'端非编码区的克隆及结构分析 |
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| 引用本文： | 吴健敏,阳玉彪,吕茂民,谢放,郭艳茹,章金刚.猪内源性反转录病毒5'端非编码区的克隆及结构分析[J].中国病毒学,2005,20(5):522-525. |
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| 作者姓名： | 吴健敏 阳玉彪 吕茂民 谢放 郭艳茹 章金刚 |
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| 作者单位： | 1. 军事医学科学院输血医学研究所,北京,100850;广西兽医研究所,广西,南宁,530001
2. 军事医学科学院输血医学研究所,北京,100850 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30270989);北京市自然科学基金(5032015);中国博士后基金(2003033195)资助项目. |
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| 摘 要： | 通过五指山猪内源性反转录病毒5'端非编码区(5'UTR)cDNA的克隆,分析其一级结构和调控元件,为进一步研究其在PERV复制、转录中的调控机制奠定基础.本研究采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)获得全长约1035bp的PERV 5'UTR.通过NCBI公共数据库BLASTn序列进行同源性分析,并应用KEGG数据库对该转录调控区进行顺式作用元件定位分析,结果发现PERV 5'UTR与GenBank公布的部分PERV 5'UTR相比较,同源性在82.6～94.8%之间.一级结构分析发现PERV 5'UTR由U3、R、U5区、引物结合区(PBS)及前导序列组成,可能的核心启动子序列与具有增强子作用的39bp重复序列分别位于U3区的-67～+1与-97～-59区段.在5'UTR转录调控区(-428～+507)鉴定出31个有效的顺式作用元件位点,其中NF-Y、TBP、Oct-1、HSF、GATA-1和GATA-2等与PERV的转录、调控密切相关.
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| 关 键 词： | PERV猪内源性反转录病毒 五指山猪 5'端非编码区 一级结构 顺式作用元件 |
| 文章编号： | 1003-5125(2005)05-0522-04 |
| 修稿时间： | 2005年4月11日 |
Cloning of Porcine Endogenous Retrovirus 5'-Untranslated Region and Analysis of its Structure |
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| WU Jian-min,YANG Yu-biao,LV Mao-min,XIE Fang,Guo Yan-ru,ZHANG Jin-gang.Cloning of Porcine Endogenous Retrovirus 5'-Untranslated Region and Analysis of its Structure[J].Virologica Sinica,2005,20(5):522-525. |
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| Authors: | WU Jian-min YANG Yu-biao LV Mao-min XIE Fang Guo Yan-ru ZHANG Jin-gang |
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