| 苏南地区1b型丙型肝炎病毒包膜区变异进化研究 |
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| 引用本文： | 许可,蒋春梅,邓小昭,丁伟良,谈永飞,张云.苏南地区1b型丙型肝炎病毒包膜区变异进化研究[J].中国病毒学,2006,21(4):333-338. |
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| 作者姓名： | 许可 蒋春梅 邓小昭 丁伟良 谈永飞 张云 |
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| 作者单位： | 许可（南京医科大学流行病与卫生统计学系,江苏,南京,210029）
蒋春梅（南京医科大学流行病与卫生统计学系,江苏,南京,210029）
邓小昭（南京军区军事医学研究所,江苏,南京,210002）
丁伟良（宜兴市第一人民医院,江苏,无锡,214200）
谈永飞（宜兴市第一人民医院,江苏,无锡,214200）
张云（南京医科大学流行病与卫生统计学系,江苏,南京,210029;南京军区军事医学研究所,江苏,南京,210002） |
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| 基金项目： | 江苏省高校自然科学基金;江苏省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 本研究旨在了解本地区丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)基因型构成的前提下,分析1b型丙型肝炎病毒包膜2(second envelope glycoprotein E2)区的变异和种系进化,并研究其准种变异与临床肝病活动度的关系.对宜兴市人民医院收集的抗HCV抗体阳性患者166名,RT-PCR方法检测HCVRNA,HCVRNA阳性患者采用型特异性引物分型法确定病毒基因型;选择其中未经干扰素治疗的43例1b型慢性丙型肝炎患者的血清标本,扩增E2区,从中选取肝硬化患者4例,慢性非肝硬化患者6例的E2区PCR产物纯化测序,序列采用CLUSTALW与GENBANK上多株不同型别的HCV序列进行比对分析,结果采用Phylip软件构建遗传进化树;并观察E2区高变区1(HVR-1)的氨基酸(amino acid,aa)残基序列的变异特征;采用单链构象多态性垂直电泳检测43例患者个体内HCV E2区准种的变异情况,比较不同肝病活动度患者准种变异情况.结果表明本地区HCV以1b型为主(84.3%),对E2区基因序列和氨基酸序列变异的分析显示其变异具有一定的规律性,种系进化树提示本地区HCV病毒序列与上海、湖南、日本等地的HCV株有较近的亲缘性.43例患者中ALT高于正常的丙型肝炎患者准种复杂程度明显高于ALT正常者(P＜0.05).故本地区HCV基因变异符合中国东南部的特点,基因变异与临床肝病活动度具有相关性.
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| 关 键 词： | 丙型肝炎病毒 包膜区2 进化树 准种 丙氨酸转氨酶 |
| 文章编号： | 1003-5125(2006)04-0333-06 |
| 修稿时间： | 2006年1月9日 |
Study On the Variation of E2 of 1b Hepatitis C Virus in the South of Jiangsu Province |
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| XU Ke,JIANG Chun-mei,DENG Xiao-zhao,DING Wei-liang,TAN Yong-fei,ZHANG Yun.Study On the Variation of E2 of 1b Hepatitis C Virus in the South of Jiangsu Province[J].Virologica Sinica,2006,21(4):333-338. |
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| Authors: | XU Ke JIANG Chun-mei DENG Xiao-zhao DING Wei-liang TAN Yong-fei ZHANG Yun |
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| Institution: | 1.1. Department of Epidemiology in Nanjing Medical University, Nanjing 210029, China2.The institute of Militalry Medicine, Nanjing Command, Nanjing 210002，China3.Yixing people’s hospital,Wuxi 214200, China. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hepatitis C virus E2 Phylogenetic tree Quasispecies ALT |
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