| 若尔盖高原湿地土壤氨氧化古菌的多样性 |
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| 引用本文： | 郑有坤,王宪斌,辜运富,张小平.若尔盖高原湿地土壤氨氧化古菌的多样性[J].微生物学报,2014,54(9):1090-1096. |
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| 作者姓名： | 郑有坤 王宪斌 辜运富 张小平 |
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| 作者单位： | 四川农业大学资源环境学院，四川成都611130;四川农业大学资源环境学院，四川成都611130;四川农业大学资源环境学院，四川成都611130;四川农业大学资源环境学院，四川成都611130 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(D010504);四川省自然科学基金(SC200902158);四川农业大学“双支计划”(01470702) |
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| 摘 要： | 【目的】研究自然界中氨氧化古菌(ammonia-oxidizing archaea,AOA)对于理解全球氮循环起着至关重要的作用,但人们对高原湿地AOA种群生态还知之甚少。本研究旨在了解若尔盖高原湿地土壤AOA群落组成及多样性。【方法】从若尔盖高原阿西(A'xi)、麦西(Maixi)和分区(Fenqu)3个典型牧区采集土壤样品,提取土壤总DNA,利用AOA氨单加氧酶(ammonia monooxygenase,amoA)基因通用引物扩增amoA基因,构建amoA基因克隆文库。从每个克隆文库中随机挑选80个阳性克隆子用于后续限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析,挑选不同酶切类型的克隆子进行测序、比对,利用MEGA 5.0软件构建amoA基因系统发育树。【结果】从3个克隆文库共240个AOA amoA基因阳性克隆中得到15条代表序列,通过Mothur软件进行OTUs(operational taxonomic units)分类得到7个不同的分类单元。其中OTU 6为优势类群,在3个克隆文库均有发现,约占所有特异性克隆子的27%。15条amoA基因序列分属于Zoige Wetland Clade 1(4 OTUs)、Zoige Wetland Clade 2(2 OTUs)和Zoige Wetland Clade 3(1OTU)3个系统发育分支。BLAST分析显示所有OTUs均归于泉古菌门(Crenarchaeota)。相关性分析表明,若尔盖高原湿地AOA多样性指数与土壤铵态氮和硝态氮含量存在显著的相关性(P0.05)。【结论】若尔盖高原湿地中AOA多样性较低,均属于泉古菌,且与土壤中氨态氮和硝态氮密切相关。
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| 关 键 词： | 若尔盖湿地 氨氧化古菌 amoA基因 多样性 |
| 收稿时间： | 2013/12/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/1/23 0:00:00 |
Diversity of ammonia-oxidizing archaea in Tibetan Zoige plateau wetland |
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| Youkun Zheng,Xianbin Wang,Yunfu Gu and Xiaoping Zhang.Diversity of ammonia-oxidizing archaea in Tibetan Zoige plateau wetland[J].Acta Microbiologica Sinica,2014,54(9):1090-1096. |
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| Authors: | Youkun Zheng Xianbin Wang Yunfu Gu and Xiaoping Zhang |
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