| 黄花大苞姜花药发育qRT-PCR内参基因筛选 |
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| 引用本文： | 张俊平,王英强.黄花大苞姜花药发育qRT-PCR内参基因筛选[J].广西植物,2018,38(1):76-83. |
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| 作者姓名： | 张俊平 王英强 |
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| 作者单位： | 1. 华南师范大学 生命科学学院 广东省植物发育生物工程重点实验室, 广州 510631; 2. 华南师范大学 生命科学学院
广州市亚热带生物多样性与环境生物监测重点实验室, 广州 510631 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金委-广东省联合基金重点支持项目(U1301213); 广东省自然科学基金重点项目(7117864)[Supported by the Joint Fund of National Science Foundation of China and Guangdong Provincial Government(U1301213); the Key Program of Natural Science Foundation of Guangdong, China(7117864)]。 |
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| 摘 要： | qRT-PCR技术具有定量准确、灵敏度高、重复性好等特点,被广泛用于基因表达分析。内参基因的稳定性对于准确分析实验结果非常重要。该研究以黄花大苞姜(Caulokaempferia coenobialis)花粉母细胞时期(PMC)、四分体时期(TET)、成熟花粉时期(MP)的花药组织为材料,基于3个阶段花药转录组表达谱数据以及常用传统内参基因,筛选出Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH)、Malate dehydrogenase(MDH)、α-tubulin3(TUA3)、β-tubulin7(TUB7)和Actin6(ACT6)作为候选内参基因,进行qRT-PCR分析;并运用BestKeeper、geNorm和Normfinder软件综合分析5个候选内参基因在黄花大苞姜花药发育过程中的表达稳定性。结果表明:MDH和TUB7的表达最稳定,ACT6的稳定性最差;分别以MDH和TUB7作为内参,分析GBE1在黄花大苞姜花药发育中的表达模式,并与该基因在花药转录组中的表达模式做相关系数分析,3种表达模式结果一致,进一步验证了MDH和TUB7的表达稳定性。这说明MDH和TUB7适合作为qRTPCR分析黄花大苞姜花药发育过程中相关基因表达模式的内参基因。该研究结果为黄花大苞姜花药发育分子机制相关研究奠定了基础,也为姜科花药发育相关内参基因的选择提供了参考。
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| 关 键 词： | 黄花大苞姜 花药 内参基因 qRT-PCR BestKeeper geNorm Normfinder |
| 收稿时间： | 2017/3/20 0:00:00 |
Selection of reference genes for quantitative real-time
PCR during anther development of
Caulokaempferia coenobialis (Zingiberaceae) |
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| ZHANG Junping,WANG Yingqiang.Selection of reference genes for quantitative real-time
PCR during anther development of
Caulokaempferia coenobialis (Zingiberaceae)[J].Guihaia,2018,38(1):76-83. |
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| Authors: | ZHANG Junping WANG Yingqiang |
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| Institution: | 1. Guangdong Provincial Key Laboratory of Biotechnology for Plant Development, College of Life Sciences, South China Normal University,
Guangzhou 510631, China; 2. Guangzhou Key Laboratory of Subtropical Biodiversity and Biomonitoring College of Life
Sciences, South China Normal University, Guangzhou 510631, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Caulokaempferia coenobialis anther reference gene quantitative realtime PCR(qRT-PCR) BestKeeper geNorm Normfinder |
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