| 基于信息量的调控元件预测方法 |
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| 引用本文： | 谢雪英,孙啸,谢建明,陆祖宏.基于信息量的调控元件预测方法[J].生物物理学报,2003,19(4):424-430. |
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| 作者姓名： | 谢雪英 孙啸 谢建明 陆祖宏 |
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| 作者单位： | 东南大学吴健雄实验室,南京,210096 |
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| 基金项目： | 863资助项目(2002AA231071)，江苏省自然科学基金资助项目(BK20022057) |
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| 摘 要： | 设计基于信息含量的调控元件识别算法，对酵母的基因表达数据聚类结果进行分析，旨在预测共表达基因上游非编码区可能存在的转录因子结合位点。分析已知受相同调控因子作用的基因上游序列的结果表明，算法能正确识别具有单一保守核心序列的调控元件和具有间隔子(spacer)的保守序列．通过分析共表达基因，算法提取出的候选调控元件，部分可能具有生物学意义，这还有待于生物学实验的进一步验证。
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| 关 键 词： | 信息含量 共表达基因 基因上游区域 调控元件 聚类 基因转录 |
| 修稿时间： | 2002年12月24 |
RECOGNITIONS OF PUTATIVE BINDING SITES BASED ON INFORMATION CONTENT |
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| XIE Xue-ying,SUN Xiao,XIE Jian-ming,LU Zu-hong.RECOGNITIONS OF PUTATIVE BINDING SITES BASED ON INFORMATION CONTENT[J].Acta Biophysica Sinica,2003,19(4):424-430. |
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| Authors: | XIE Xue-ying SUN Xiao XIE Jian-ming LU Zu-hong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Information content Co-expression gene Gene upstream region Binding site Cluster |
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