| IgA 肾病患者与膜性肾病患者外周血单核细胞mRNA分析 |
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| 引用本文： | 梁爽,凡奎,张燕,谢杨眉.IgA 肾病患者与膜性肾病患者外周血单核细胞mRNA分析[J].生物信息学,2020,18(3):163-168. |
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| 作者姓名： | 梁爽 凡奎 张燕 谢杨眉 |
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| 作者单位： | 四川省三台县人民医院 肾内科,四川 绵阳 621100 |
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| 摘 要： | 为了寻找诊断、鉴别IgA肾病(IgAN)和膜性肾病(MN)的血液特异性标记物,利用公共数据库中的IgAN和MN患者的外周血单核细胞(PBMCs)的转录组表达谱数据集识别特异性生物标记物,为诊断和鉴别提供简便、可靠的依据补充。从公共基因表达数据库(GEO)下载IgAN患者组(n=15)和MN患者组(n=8)芯片数据集,筛选前250个差异表达基因(DEGs)。通过分析筛选关键基因和途径,进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析和蛋白质与蛋白质相互作用关系(PPI)分析等进一步了解DEGs。通过分析共发现75个显著DEGs,其中73个上调基因,2个下调基因。GO富集分析的生物学过程(BP)主要包括蛋白质转运、内溶酶体到溶酶体转运、趋化因子介导的信号通路作用等。显著富集差异表达基因KEGG通路分析包括Endocytosis和Hepatitis B的相关信号通路。PPI筛选出EPS15、STAT4、CCL2、SUN2、SEC24C、SEC31A、GOLGB1、F2R,RAB12和PTK2B等关键基因。成功筛选出核心差异表达基因,为IgAN和MN的诊断和鉴别提供简便、可靠的依据补充,甚至提供治疗的新靶点。
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| 关 键 词： | IgA肾病 膜性肾病 外周血单核细胞 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2019/9/13 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/11/13 0:00:00 |
mRNA analysis of peripheral blood monocytes in patients with IgA nephropathy and with membranous nephropathy |
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| LIANG Shuang,FAN Kui,ZHANG Yan,XIE Yangmei.mRNA analysis of peripheral blood monocytes in patients with IgA nephropathy and with membranous nephropathy[J].China Journal of Bioinformation,2020,18(3):163-168. |
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| Authors: | LIANG Shuang FAN Kui ZHANG Yan XIE Yangmei |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | IgA nephropathy Membranous nephropathy Peripheral blood mononuclear cells Bioinformatics |
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