| 基于TCGA数据库结肠癌RBL1基因甲基化水平的诊断与预后分析 |
| |
| 引用本文： | 潘冉冉,季慧慧,黄天怡,胡豪畅,段世伟. 基于TCGA数据库结肠癌RBL1基因甲基化水平的诊断与预后分析[J]. 中国细胞生物学学报, 2019, 0(2): 235-242 |
| |
| 作者姓名： | 潘冉冉 季慧慧 黄天怡 胡豪畅 段世伟 |
| |
| 作者单位： | 宁波大学医学院医学遗传中心 |
| |
| 基金项目： | 宁波大学王宽诚基金资助的课题~~ |
| |
| 摘 要： | 视网膜母细胞瘤样蛋白1(RBL1/p105)是视网膜母细胞瘤蛋白质家族的成员之一,RBL1通常被认为是抑癌基因,在细胞增殖、凋亡、分化中发挥重要作用。该文探讨RBL1基因在结肠癌诊断和预后中的作用和可能的机制。利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的结肠癌病例资料和芯片数据,筛选RBL1基因差异甲基化位点,并通过Cox回归模型研究甲基化位点与结肠癌患者预后之间的关系。该研究发现,待研究的癌组织RBL1基因启动子甲基化水平高于癌旁组织(0.120±0.012 vs 0.113±0.008, P=0.000 04)。随后,研究者采用受试者工作特征(ROC)曲线来评价RBL1基因启动子甲基化水平的诊断价值,用曲线下面积(AUC)作为诊断价值的评判标准。研究发现,启动子区甲基化的AUC达到0.732,对应的灵敏度为80.5%、特异度为55.3%。Cox多因素分析结果发现, cg04086771高甲基化是结肠癌患者预后的独立危险因素(P=0.002)。该研究通过对TCGA数据库的挖掘,发现RBL1基因启动子区甲基化均值可能与结肠癌发病风险有关,同时RBL1基因的甲基化位点的甲基化水平对结肠癌的预后有影响。
|
| 关 键 词： | 结肠癌 TCGA RBL1基因 甲基化 生物标志物 预后 |
Analysis of Potential Diagnostic and Prognostic Value of the Methylation Levels of RBL1: A Study Based on TCGA Database |
| |
| Pan Ranran,Ji Huihui,Huang Tianyi,Hu Haochang,Duan Shiwei. Analysis of Potential Diagnostic and Prognostic Value of the Methylation Levels of RBL1: A Study Based on TCGA Database[J]. , 2019, 0(2): 235-242 |
| |
| Authors: | Pan Ranran Ji Huihui Huang Tianyi Hu Haochang Duan Shiwei |
| |
| Affiliation: | (Medical Genetics Center,School of Medicine,Ningbo University,Ningbo 315211,China) |
| |
| Abstract: | Pan Ranran;Ji Huihui;Huang Tianyi;Hu Haochang;Duan Shiwei(Medical Genetics Center,School of Medicine,Ningbo University,Ningbo 315211,China) |
| |
| Keywords: | colon cancer TCGA RBL1 gene DNA methylation biomarker prognosis |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
|
