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猪繁殖与呼吸综合征病毒S1株基因组序列测定和分析
引用本文:李玉峰,姜平,XU Jia-rong,许家荣,蒋文明.猪繁殖与呼吸综合征病毒S1株基因组序列测定和分析[J].中国病毒学,2006,21(5):490-493.
作者姓名:李玉峰  姜平  XU Jia-rong  许家荣  蒋文明
作者单位:南京农业大学动物医学院,江苏南京,210095
基金项目:国家自然科学基金;教育部优秀青年教师资助计划;新世纪优秀人才资助项目;教育部科研项目
摘    要:应用RT-PCR方法分段扩增出PRRSV上海分离株S1毒株的4条基因大片段,扩增后的产物分别克隆于pCR-XL-TOPO载体鉴定后测序,同时应用RACE方法对S1毒株的3'和5'基因末端进行了成功的扩增并克隆于pMD-18T载体进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSV S1株全基因组cDNA序列.测序结果表明PRRSV S1株基因组全长15441 bp,包含9个开放式阅读框,5'UTR含有189nt,3'端UTR含有181nt,其中包含30nt Poly (A).基因组序列分析结果显示该病毒与ATCC VR-2332和BJ-4分离株的核苷酸同源性分别99.5%和99.6%.与另一国内分离株CH-1a的核苷酸同源性为90.8%.

关 键 词:基因组  序列测定和分析
文章编号:1003-5125(2006)05-0490-04
修稿时间:2006年4月6日

Genomic Sequencing of S1 Strain of a Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolate
XU Jia-rong.Genomic Sequencing of S1 Strain of a Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolate[J].Virologica Sinica,2006,21(5):490-493.
Authors:XU Jia-rong
Abstract:
Keywords:PRRSV
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