首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

基于小鼠肝细胞癌全转录组测序的Cbx3基因上调表达机制分析
作者姓名:钱绘  张泽  李书  孙丽双  唐玉莲  倪安妮  蒋利和  李根亮
作者单位:1. 右江民族医学院基础医学院;2. 南京农业大学动物科技学院
基金项目:国家自然科学基金项目(31960728、31760758);;广西壮族自治区研究生教育创新计划项目教改项目(JGY2020164))共同资助;
摘    要:为了探讨染色质盒蛋白3(chromobox 3,Cbx3)基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中上调表达的可能机制,通过构建小鼠HCC模型,分别取30 d的瘤体组织和癌旁组织及接种0、3、30 d未成瘤小鼠的肝组织,通过全转录组测序和生物信息学手段分析Cbx3基因在瘤体组织及各对照组织中的表达,并进一步筛选与Cbx3或其编码蛋白有蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction, PPI)、竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)和靶标关系的差异(q<0.05,n=3,下同)表达基因[以下将Cbx3编码蛋白PPI涉及的蛋白的编码基因称Cbx3相关基因(Cbx3-associated gene, CAG)],并分析其功能。结果显示,与对照组相比,瘤体组织中Cbx3上调表达,且存在4个Cbx3转录本及116个CAG。其中转录本NM_007624.3尽管在各组织中皆有大量表达,但在瘤体组织的表达远高于各对照组织的。GO功能富集分析结果显示,Cbx3基因及CAG主要存在于细胞核中,共同参...

关 键 词:肝细胞癌  Cbx3  转录本  小RNA  竞争性内源RNA
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号