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丹参SmHB12基因生物信息学及表达分析
作者姓名:白艳红  窦家聪  周颖  雷乔期  王钰  张永清  刘谦
作者单位:1. 山东中医药大学药学院;2. 山东省农业技术推广中心
基金项目:国家自然基金项目(82003892);;国家现代农业产业技术体系(CARS-21)共同资助;
摘    要:植物同源异型域-亮氨酸拉链Ⅰ(homeodomain-leucine zipperⅠ, HD-ZipⅠ)转录因子在响应非生物胁迫方面发挥了重要作用。本研究根据干旱胁迫下丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)幼苗根转录组数据,克隆获得丹参HB12(SmHB12)基因片段并进行测序验证,其开放阅读框长度603bp,编码200个氨基酸。蛋白理化性质分析表明蛋白质相对分子量为22.95 kDa,理论等电点为5.42,含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点。亚细胞定位结果表明SmHB12蛋白定位于细胞核。实时荧光定量PCR结果表明SmHB12基因在不同组织中均有表达,花中表达量最高,其次是茎和叶,根中最低,并受脱落酸(ABA)和聚乙二醇-6000 (PEG-6000)胁迫强烈诱导。上述结果为后续开展SmHB12基因的功能研究提供理论依据。

关 键 词:丹参  SmHB12  生物信息学分析  表达分析
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