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人CLDN10a启动子的克隆及活性分析
作者姓名:周雯  杨智  时凤敏  符碧薇  吴岩  唐敏  郑琳  王青松
作者单位:1. 海南医学院组织胚胎学教研室;2. 海南医学院形态学实验室;3. 海南医学院生物技术专业实验室;4. 海南医学院生物化学与分子生物学教研室
基金项目:海南省自然科学基金项目(817141、820MS054);;国家自然科学基金项目地区科学基金项目(82060153、81460043)共同资助;
摘    要:CLDN基因家族编码构成细胞间紧密连接的主要跨膜蛋白Claudins,在维持细胞极性、信号转导和恶性肿瘤复发转移中发挥重要作用。CLDN10基因属于CLDN家族,有包括CLDN10a在内的多个转录本。本研究利用多种生物信息学方法分析CLDN10a的5′侧翼序列的特征和转录因子结合位点,采用基因合成、PCR扩增和分子克隆构建5′缺失的不同长度的CLDN10a启动子荧光素酶报告基因载体,瞬时转染HEK-293T细胞,通过双荧光素酶报告基因系统检测不同长度片段的启动子活性。生物信息学分析结果显示,CLDN10a的上游转录调控区序列(-2 000~+460 bp)含有TATA box、GC box和CAAT box,存在1个CpG岛,有4个启动子位置,有1个RNA聚合酶Ⅱ核心启动子;MatInspector和Jaspar分析发现,有75种可能的转录因子结合位点(评分≥0.99)。PCR和测序结果显示,成功构建了6个不同长度的CLDN10a启动子的双荧光素酶报告基因质粒。荧光素酶活性检测表明,-1 890~-1 100 bp、-1 000~-890 bp、-890~-150 bp和-150~+4...

关 键 词:CLDN10  启动子  双荧光素酶报告基因系统  生物信息学
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