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| 罗汉果查尔酮合成酶基因的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 王志强,蒙姣荣,邹承武,黄锦宽,林纬,黎起秦,陈保善.罗汉果查尔酮合成酶基因的生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2010,29(3). |
| 作者姓名： | 王志强 蒙姣荣 邹承武 黄锦宽 林纬 黎起秦 陈保善 |
| 作者单位： | 1. 广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,南宁,530005 2. 广西大学生命科学与技术学院,南宁,530005 3. 广西大学农学院,南宁,530005 4. 广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,南宁,530005;广西大学生命科学与技术学院,南宁,530005 |
| 基金项目： | 广西重点实验室能力建设计划项目，广西自然科学基金项目 |
| 摘 要： | 查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮生物合成的关键酶,在植物发育、防止UV损伤、抗病和逆境反应中起着重要作用。本研究通过EST测序,获得了罗汉果查尔酮合成酶基因序列(登录号:GU980155)。为了进一步了解罗汉果查尔酮合成酶基因的特征,我们将其与46种植物的查尔酮合成酶基因的核酸序列和氨基酸序列进行比对和进化分析。结果表明,罗汉果查尔酮合成酶基因的核酸序列和氨基酸序列与其它物种的查尔酮合成酶基因均具较高同源性,编码区相似性约为94%。使用PHYLIP和MEGA4分别构建了邻接树、最大似然树和最大简约树,但经bootstrap检验,最优树未能明确罗汉果查尔酮合成酶基因的系统发育地位。以紫花苜蓿查尔酮合成酶的三维结构为参考,利用同源建模的方法预测了罗汉果查尔酮合成酶的三维结构,发现罗汉果查尔酮合成酶具有保守的活性位点和空间结构。 |
| 关 键 词： | 罗汉果 查尔酮合成酶基因 进化分析 |
Bioinformatics Analysis of the Chalcone Synthase Gene from Luo Han Guo (Siraitia grosvenorii) |
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| Wang Zhiqiang,Meng Jiaorong,Zou Chengwu,Huang Jinkuan,Lin wei,Li qiqin,Chen Baoshan.Bioinformatics Analysis of the Chalcone Synthase Gene from Luo Han Guo (Siraitia grosvenorii)[J].Genomics and Applied Biology,2010,29(3). | |
| Authors: | Wang Zhiqiang Meng Jiaorong Zou Chengwu Huang Jinkuan Lin wei Li qiqin Chen Baoshan |
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