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小花草玉梅正常和自然变异植株的AP3-3基因研究
引用本文:张 婷,邢 妮,王 超,刘虎岐.小花草玉梅正常和自然变异植株的AP3-3基因研究[J].西北植物学报,2016,36(2):231-240.
作者姓名:张 婷  邢 妮  王 超  刘虎岐
作者单位:(西北农林科技大学 生命科学学院,陕西杨陵 712100)
基金项目:中医药行业科研专项(201207002);中医药公共卫生专项(财社[2011]76号)
摘    要:野生小花草玉梅(Anemone rivularis var.flore-minore)正常植株和花被片自然变异植株的外观形态差异很大,该研究以二者为材料,利用常规PCR和高效热不对称PCR(Hi-Tail PCR)技术从其正常和变异植株的基因组中各分离得到1个B类基因。序列分析证明,二者隶属于B类MADS-box基因AP3家族的旁系同源基因AP3-3分枝,分别命名为NArAP3-3(正常植株)和VArAP3-3(变异植株)。NArAP3-3基因全长3 795bp,VArAP3-3基因全长3 898bp,二者均含有1个666bp的开放阅读框(ORF),可编码221个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构,其编码肽链包含了MADS区、K区、Ⅰ区和C区。对比NArAP3-3和VArAP3-3基因的全长序列,发现VArAP3-3基因比NArAP3-3多了1段49bp的插入,且在ORF序列与NArAP3-3基因相比有4个碱基突变。对二者的全长序列、所编码的221个氨基酸及插入序列的生物信息学分析显示,二者在基因启动子、蛋白质基本性质、结构功能域、二级三级预测结构等方面均有差异,推测这些差异可能是花被片变异产生的原因之一。该研究结果为进一步探索其变异机制奠定了基础。

关 键 词:小花草玉梅  花被片变异  Hi-Tail  PCR  MADS-box基因  NArAP3-3和VArAP3-3基因

Cloning and Sequence Analysis of AP3-3 Gene in Normal Plant and Natural Variant from Anemone rivularis var.flore-minore
ZHANG Ting,XING Ni,WANG Chao,LIU Huqi.Cloning and Sequence Analysis of AP3-3 Gene in Normal Plant and Natural Variant from Anemone rivularis var.flore-minore[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2016,36(2):231-240.
Authors:ZHANG Ting  XING Ni  WANG Chao  LIU Huqi
Abstract:
Keywords:Anemone rivularis var  flore-minore  tepals variation  Hi-Tail PCR  MADS-box gene  NArAP3-3 and VArAP3-3 genes
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