基于HP模型的大麻素受体CB2折叠研究 |
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作者姓名: | 梁凡 董宇 李正夫 李姣姣 纪兆辉 |
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作者单位: | 淮海工学院 计算机工程学院,江苏 连云港 222005,淮海工学院 计算机工程学院,江苏 连云港 222005,淮海工学院 计算机工程学院,江苏 连云港 222005,淮海工学院 药学院,江苏 连云港 222005,淮海工学院 计算机工程学院,江苏 连云港 222005 |
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基金项目: | 江苏省高等学校自然科学研究资助项目 (No.17KJD520002, No.17KJB350002);淮海工学院科研基金资助项目(No.Z2015012); 江苏省大学生创新创业训练计划项目(No.SZ201811641106001). |
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摘 要: | Cannabinoid receptor Type 2(简称CB2)是大麻素受体的一种亚型,因为其无中枢神经副作用,不会产生成瘾性及耐受性,显示出了非常好的开发前景和潜在的应用价值。其作为免疫调节剂、神经保护剂和抗癌药等将具有巨大市场价值。目前,CB2蛋白的空间结构还未被测定出来,对于CB2的折叠问题研究也开展的较少,为了研究大麻素受体亚型蛋白CB2的折叠问题以及方便更多的研究人员对CB2空间结构和相关药理特性的研究,本文提出了一种基于HP模型的折叠求解方法。通过使用回溯机制和蒙特卡罗方法对此优化问题进行求解,算法可有效的在全局范围内进行寻找最优解,避免了掉入局部最优问题。实验结果表明,本文方法获取的CB2蛋白空间构象具有较低的能量值,折叠情况较好。
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关 键 词: | 蛋白质折叠 HP模型 大麻素受体 蒙特卡罗 |
收稿时间: | 2018-04-27 |
修稿时间: | 2018-06-03 |
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