红树科陆生植物竹节树的转录组分析

为了探究竹节树（Carallia brachiata）适应环境的基因表达机制,分析了竹节树8个组织（根、茎、叶、花、胚珠、果实、种子、胚）的转录组数据。结果显示繁殖器官（果实、种子、胚）和营养器官（根、茎、叶）的基因表达呈现相反趋势,即在营养器官中高表达的基因在繁殖器官中低表达,同时大部分基因在繁殖器官中呈现低表达。8个组织的特异表达基因显著富集在35个通路中。与营养器官相比,繁殖器官的特异表达基因主要富集在一些与物质合成相关的通路中,如碳水化合物、氨基酸、脂类等物质。各组织间比较所得的特异基因主要富集在53条通路中,其中糖酵解/糖异生是一条中心通路,该通路的几个关键基因在繁殖器官中的表达显著高于营养器官。结果表明,竹节树的基因表达谱与其陆生环境以及种子繁殖方式基本一致。