丹参异戊烯焦磷酸异构酶基因(SmIPI)的生物信息学及表达分析 |
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作者姓名: | 杨滢 周露 化文平 王喆之 李翠芹 |
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作者单位: | 教育部药用资源与天然药物化学重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安710062 |
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基金项目: | 陕西师范大学中央高校基本科研业务费重点项目(GK200901014). |
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摘 要: | 异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)是萜类合成途径的关键酶之一。本文在丹参转录组高通量数据分析的基础上,对丹参IPI基因(SmIPI)进行了克隆及序列分析。SmIPI脸长1234bp,包含681bp的开放读码框,编码226个氨基酸。生物信息学结构分析表明,SmIPI亲水性α/β蛋白,包含有IPI结构域,在序列组成、结构及活性位点等方面与其他植物的IPI均具有高度的相似性。实时荧光定量PCR分析结果表明,SmIPI在丹参生长的各个时期和不同组织器官中差异表达,其表达受病原菌和茉莉酸甲酯的诱导。
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关 键 词: | 丹参 异戊烯焦磷酸异构酶 生物信息学分析 实时荧光定量PCR 表达模式 |
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