| 中粒咖啡WRKY基因家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 付 春,唐 雪,杨瑶君,江 纳.中粒咖啡WRKY基因家族的生物信息学分析[J].广西植物,2021,41(11):1905-1919. |
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| 作者姓名： | 付 春 唐 雪 杨瑶君 江 纳 |
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| 作者单位： | 1. 乐山师范学院 竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室, 四川 乐山, 614000; 2. 乐山师范学院 生命科学学院,
四川 乐山, 614000; 3. 乐山师范学院 数学与信息科学学院, 四川 乐山, 614000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31470655); 四川省科技厅项目(17ZZ019); 乐山市科技局重点研究项目(18JZD101); 乐山师范学院人才启动项目(XJR17005); 乐山师范学院重点研究项目(LZD010); 乐山师范学院横向项目(LHX190786)[Supported by the National Natural Science Foundation of China(31470655); Sichuan Provincial Science and Technology Department Project(17ZZ019); Key Research Project of Leshan Municipal Science and Technology Bureau(18JZD101); Leshan Normal University Talent Launch Project(XJR17005); Key Research Project of Leshan Normal University(LZD010); Cooperative Project of Leshan Normal University(LHX190786)]。 |
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| 摘 要： | WRKY转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,作为植物中最大的转录因子家族之一,在植物的多种应激反应中发挥着重要作用。该文利用生物信息学方法对中粒咖啡WRKY蛋白家族的理化特性及其分子进化进行了详细分析。结果表明:(1)CcWRKY蛋白氨基酸数量在103～994个之间,均无信号肽,推测其为非分泌性蛋白; 其二级结构以无规则卷曲为最主要的结构元件,三级结构主要分为6类,其中以CcWRKY15、CcWRKY25、CcWRKY37和CcWRKY42为主要成员的D类结构最稳定。(2)保守结构域及进化树分析结果显示,中粒咖啡WRKY基因家族含有49个成员,其中的10个成员归为WRKY第Ⅰ家族,34个成员归为WRKY第Ⅱ家族,5个成员归为WRKY第Ⅲ家族。(3)中粒咖啡 WRKY47基因与其他物种的系统进化分析结果显示,WRKY47与烟草亲缘关系最近,与非洲油棕(Elaeis guineensis)亲缘关系最远,说明WRKY47蛋白在生物进化过程中比较保守。该研究结果可为中粒咖啡WRKY基因家族分子功能的深层次研究提供一定的借鉴作用,对进一步探究中粒咖啡WRKY基因的功能、进化以及分子育种具有重要意义。
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| 关 键 词： | 中粒咖啡 WRKY 转录因子 系统进化 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2020/5/20 0:00:00 |
Bioinformatics analysis of WRKY gene
family in Coffea canephora |
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| FU Chun,TANG Xue,YANG Yaojun,JIANG Na.Bioinformatics analysis of WRKY gene
family in Coffea canephora[J].Guihaia,2021,41(11):1905-1919. |
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| Authors: | FU Chun TANG Xue YANG Yaojun JIANG Na |
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| Institution: | 1. Bamboo Disease and Pests Control and Resources Development Key Laboratory of Sichuan Province, Leshan Normal University, Leshan
614000, Sichuan, China; 2. College of Life Science, Leshan Normal University, Leshan 614000, Sichuan, China; 3. College of
Mathematics and Information Science, Leshan Normal University, Leshan 614000, Sichuan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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