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牦牛MEF2C基因克隆、生物信息学及表达谱分析
引用本文:王兴东,吴晓云,郭宪,马进寿,殷满才,阎萍. 牦牛MEF2C基因克隆、生物信息学及表达谱分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2021, 40(4): 1505-1512. DOI: 10.13417/j.gab.040.001505
作者姓名:王兴东  吴晓云  郭宪  马进寿  殷满才  阎萍
作者单位:中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州,730050;甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州,730050;西北民族大学生命科学与工程学院,兰州,730030;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州,730050;甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州,730050;青海省大通种牛场,西宁,810000
摘    要:
本试验旨在分析牦牛(Bos grunniens)肌细胞增强因子2C(myocyte enhancer factor 2C,MEF2C)基因的分子特征和表达规律,探索其影响牦牛肌肉发育的作用机制.试验以大通牦牛肌肉组织cDNA为模板,采用PCR扩增技术扩增牦牛MEF2C基因,用DNAStar,ExPASy,ABCpred等生物信息学软件分析MEF2C基因序列和其编码的蛋白质结构,利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测了 MEF2C基因的表达情况.试验克隆获得的牦牛MEF2C基因编码区全长1 302 bp,编码433个氨基酸;蛋白质结构预测结果显示,MEF2C蛋白具有30h的半衰期,为亲水性碱性蛋白,没有信号肽但拥有跨膜结构.系统关系中牦牛与普通牛的亲缘关系最为接近,与小鼠亲缘关系较远.组织表达谱结果显示,MEF2C基因在牦牛7个组织中都有表达且在臀二头肌组织中表达量最高;不同时期MEF2C基因表达情况为胎牛>成年牛>6月龄牛.研究结果将为进一步探讨MEF2C基因在牦牛肌肉发育中的作用提供科学依据,同时也为解析牦牛肌肉发育的分子机制提供数据支撑.

关 键 词:MEF2C  RT-qPCR  大通牦牛  生物信息学分析

Cloning Bioinformatics Analysis and Expression Profiling of Yak MEF2C Gene
Wang Xingdong,Wu Xiaoyun,Guo Xian,Ma Jinshou,Yin Mancai,Yan Ping. Cloning Bioinformatics Analysis and Expression Profiling of Yak MEF2C Gene[J]. Genomics and Applied Biology, 2021, 40(4): 1505-1512. DOI: 10.13417/j.gab.040.001505
Authors:Wang Xingdong  Wu Xiaoyun  Guo Xian  Ma Jinshou  Yin Mancai  Yan Ping
Abstract:
Keywords:
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