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甘肃不同矿区样品中的细菌多样性
引用本文:王永刚,王江勤,罗文,冷非凡.甘肃不同矿区样品中的细菌多样性[J].基因组学与应用生物学,2021,40(3):1187-1195.
作者姓名:王永刚  王江勤  罗文  冷非凡
作者单位:兰州理工大学生命科学与工程学院,兰州,730050
摘    要:甘肃矿产资源丰富,矿区酸性矿坑水(acid mine drainage,AMD)及周边土壤中嗜酸微生物种类丰富,具有相当大的研究价值.本研究通过Illumina高通量测序方法,对甘肃省4个矿区AMD及周边土壤中的细菌群落组成、相似性及功能组成进行分析.结果 表明,煤矿样品GNM细菌物种组成最为丰富,金矿样品LNJ1与紫金矿样品LNZJK细菌组成最相似,与属于铜矿的BYT物种较相近,与LNJ1同地区的LNJ2样品细菌组成相比较远.所有样品细菌主要分为放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteriodetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)四大门,其中变形菌门(Proteobacteria)丰度最高.放线菌门(Actinobacteria)中不动杆菌属(Acinetobacter)、类诺卡氏属(Nocardioides)和芽球菌属(Blastococcus)表现出较高丰度;厚壁菌门(Firmicutes)中微小杆菌属(Exiguobacterium)和芽孢杆菌属(Bacillus)表现出较高丰度,且微小杆菌属(Exiguobacterium)丰度极高.通过功能预测发现,与煤矿样品GNM相比,LNJ1、LNJ2、BYT和LNZJK4个金属矿区样品中的微生物具有较强的氨基酸与碳源的转运与代谢、转录等功能以及较低的能量生产与转运、无机离子转运与代谢能力.通过探究AMD中的细菌多样性及其与重金属之间的相互关系,了解AMD采样区微生物群落结构,以期挖掘出更为丰富的具有重金属抗性的菌株资源,以应用于生物浸矿和环境修复等领域.

关 键 词:酸性矿坑水(AMD)  嗜酸菌  微生物多样性  高通量测序  功能预测

Bacterial Diversity in Different Mining Area Samples of Gansu Province
Wang Yonggang,Wang Jiangqin,Luo Wen,Leng Feifan.Bacterial Diversity in Different Mining Area Samples of Gansu Province[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(3):1187-1195.
Authors:Wang Yonggang  Wang Jiangqin  Luo Wen  Leng Feifan
Abstract:
Keywords:
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