| 文冠果性别分化关键期花芽转录组分析 |
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| 引用本文： | 郑雅琪,敖妍,王旭,刘阳,刘小天,李志虹.文冠果性别分化关键期花芽转录组分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(3):1254-1267. |
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| 作者姓名： | 郑雅琪 敖妍 王旭 刘阳 刘小天 李志虹 |
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| 作者单位： | 北京林业大学,省部共建森林培育与保护教育部重点实验室,北京,100083;国家能源非粮生物质原料研发中心,北京,100083;科右前旗农牧和科技局农业研究所,兴安盟,137713 |
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| 摘 要： | 为探究文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)性别分化过程的分子机制,本研究对其性别分化关键期花芽进行RNA-seq分析.结果 共获得37.13 Gb原始数据,de novo组装后共产生29430条Unigenes,平均长度1144 bp,其中21887条Unigenes获得功能注释.此外,共得到差异基因4864个,其中相对于性别分化前期(Ta)差异上调基因3003个,差异下调基因1861个.GO富集分析显示,差异基因主要注释到代谢进程、植物激素信号转导、生长素激活的信号通路等功能.KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等生物功能.还筛选出6个MADS-box相关基因(TR576|c0_g1,TR7438|c0_g1,TR10037|c1_g10,TR13325|c0_g1,TR 6316|c0_g1,TR5807|c0_ g1),参与雄蕊发育、花粉管生长、花发育调节、花瓣发育、胚珠发育、转录因子活性等过程调节.RT-qPCR检测了16个基因在两个时期的表达量,结果均与RNA-seq一致.研究结果将为进行文冠果性别分化过程中基因表达分析提供参考.
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| 关 键 词： | 文冠果 花芽 转录组 性别分化 |
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