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球毛壳菌循环肽HC-毒素基因的序列分析
引用本文:金红星,杨谦,张昕. 球毛壳菌循环肽HC-毒素基因的序列分析[J]. 生物技术, 2004, 14(5): 3-4
作者姓名:金红星  杨谦  张昕
作者单位:1. 哈尔滨工业大学生命科学与工程系,黑龙江,哈尔滨,150001
2. 吉林大学生物与农业工程学院,吉林,长春,130022
基金项目:“国家 863”项目 (“新型微生物药剂创制与发酵工程技术研究与产品开发” ,2 0 0 3AA2 4 1 1 4 0 )
摘    要:为了验证Phrap软件是否适合在EST分析中应用,对球毛壳菌循环肽HC-毒素基因进行了序列分析。根据EST分析的结果,从cDNA文库中挑取循环肽HC-毒素基因的克隆进行了测序并序列分析。结果表明cDNA文库中循环肽HC-毒素基因的克隆插入片断大小为1217bp;用Phrap软件拼接出来的循环肽HC-毒素的表达序列标签拼接序列与实际序列不完全一致,因此Phrap软件不适合在EST分析中应用。

关 键 词:球毛壳菌 循环肽HC-毒素基因 生物防治
文章编号:1004-311X(2004)05-0003-02
修稿时间:2004-04-20

Sequence Analysis for Cyclic Peptide HC- toxin Gene of Chaetomium globosum
JIN Hong-xing,YANG Qian,ZHANG Xin. Sequence Analysis for Cyclic Peptide HC- toxin Gene of Chaetomium globosum[J]. Biotechnology, 2004, 14(5): 3-4
Authors:JIN Hong-xing  YANG Qian  ZHANG Xin
Affiliation:JIN Hong-xing~1,YANG Qian~1,ZHANG Xin~2
Abstract:Cyclic peptide HC-toxin gene sequence Chaetomium globosum of was analyzed,in order to whether or not Phrap suitable for EST analyzing.According to the results of EST analysis of Chaetomium globosum,a cyclic peptide HC-toxin gene of clone was selected from the cDNA library,and then sequenced and analyzed it.The result showed that the insert of the cyclic peptide HC-toxin gene clone was 1,217bp,and the sequence was not consistent completely with assembled sequence by the software Phrap.Therefore it was not appropriate for analyzing EST using Phrap.
Keywords:Chaetomium globosum  cyclic peptide HC-toxin  bio-control
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