基于病例转录组特征的精准用药搜索系统

癌症发病率的升高威胁着人类健康,但是癌症作为复杂疾病及其异质性为治疗带来困难。随着测序技术的快速发展,精准医疗应运而生。到目前为止,积累了大量的精准医疗的临床实践知识和癌症的用药预测资源,但是方便医生和癌症患者利用这方面知识的搜索系统还有待发展。我们建立了一个搜索系统,根据精准用药知识库指出的用药特征,包括单碱基变异(SNV)、基因突变、基因融合、基因或蛋白过表达、癌症驱动基因突变、高甲基化、拷贝数变异以及信号通路活动等特征,分别建立相应的搜索规则,实现根据癌症患者的转录组特征,包括SNV、基因融合和基因表达量等,给予医生和患者快速方便的用药参考。