水稻PAL基因的全基因组分析及胁迫表达研究 |
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引用本文: | 曾嘉丽,欧阳林娟,刘家林,贺浩华,朱昌兰,彭小松,贺晓鹏,傅军如,陈小荣,边建民,徐杰,孙晓棠,周大虎,胡丽芳.水稻PAL基因的全基因组分析及胁迫表达研究[J].基因组学与应用生物学,2018(9). |
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作者姓名: | 曾嘉丽 欧阳林娟 刘家林 贺浩华 朱昌兰 彭小松 贺晓鹏 傅军如 陈小荣 边建民 徐杰 孙晓棠 周大虎 胡丽芳 |
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作者单位: | 江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室;江西省超级稻工程技术研究中心;双季稻现代化生产协同中心 |
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摘 要: | 苯丙氨酸酶(phenylalanine enzyme,PAL)是催化苯丙烷次级代谢过程中的重要限速酶,对植物生长发育意义重大。为进一步探讨水稻OsPAL基因的功能,利用生物信息学的方法,在水稻全基因组水平上对OsPAL基因家族进行了进化树、基因结构、染色体定位等方面的分析。数据表明,水稻基因组中共存在9个PAL基因,命名为OsPAL1~Os PAL9,编码681~719个氨基酸,都含有一个保守性很高的Lyase aromatic结构域,集中分布于第2、4、5、11和12号染色体上。进化树的分析表明,9个Os PAL基因可分为三类亚家族:Ⅰ类(Os PAL2-4,OsPAL6-7),Ⅱ类(OsPAL8-9)和Ⅲ类(OsPAL1,OsPAL5),3类比较明显的区别是蛋白N端的前30个氨基酸。荧光定量q RT-PCR分析表明,除Os PAL8外,其它8个基因的表达至少受干旱、低温、Na Cl和ABA等4种胁迫中的一种响应。
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