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Nucleosome Clutches are Regulated by Chromatin Internal Parameters
Affiliation:1. Center for the Physics of Living Cells, University of Illinois at Urbana–Champaign, Urbana, IL 61801, USA;2. Department of Physics, University of Illinois at Urbana–Champaign, Urbana, IL 61801, USA;3. Beckman Institute for Advanced Science and Technology, University of Illinois at Urbana–Champaign, Urbana, IL 61801, USA
Abstract:
Keywords:nucleosome clutches  mesoscale modeling  nucleosome positions  linker histone density  histone acetylation levels  Ac"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0035"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  acetylation  bp"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0045"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  base pairs  DBSCAN"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0055"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  Density-based clustering algorithm  LH"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0065"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  linker histone  LLs"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0075"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  linker lengths  MNase-seq"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0085"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  micrococcal nuclease sequencing  MC"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0095"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  Monte Carlo  mESC"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0105"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  mouse embryonic stem cells  NPC"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0115"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  neural progenitor cells  NFRs"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0125"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  nucleosome free regions  NRL"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  k0135"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  nucleosome repeat length
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