红色原鸡和中国家鸡遗传多样性及亲缘关系

对红色原鸡（Gallus gallus）和中国家鸡（Gallus domesticus）之间的遗传多样性和亲缘关系进行系统分析，可以为中国家鸡的起源进化、种质资源保护以及科学开发利用等研究提供理论依据，但迄今尚未见用微卫星标记进行分析比较的公开报道．本研究利用29对微卫星引物对红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种和Gallus gallus gallus亚种以及14个中国家鸡品种的568只个体进行扫描，共检测到286个等位基因，平均值为9．86±6．36；所有群体的期望杂合度为0．6708±0．0251，皖南三黄鸡的期望杂合度最高（0．6442），固始鸡的最低（0．4532）．单个位点偏离Hardy-Weinberg平衡的群体数从0-7不等．整个群体平均遗传分化为17．9％（P〈0．001），约有16．7％的遗传变异源自群体间的差异，所有的位点都极显著地贡献于这一结果（P〈0．001）；杂合子缺失的水平很高，为0．015（P〈0．01），有8个位点显示显著的杂合子缺失．群体间的Reynolds’遗传距离从0．036（萧山鸡-鹿苑鸡）～0．371（泰国红色原鸡-河南斗鸡）不等，而Nm值变异范围为从0．583（泰国红色原鸡-河南斗鸡）～5．833（萧山鸡鹿苑鸡）．NJ系统发生树中，鹿苑鸡、萧山鸡、北京油鸡、河南斗鸡、淮南麻黄鸡、狼山鸡等重体型的鸡种首先形成一大类；鹿苑鸡与萧山鸡以及茶花鸡与藏鸡有着较近的遗传关系；茶花鸡和藏鸡与两个红色原鸡亚种亲缘关系较近，中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种与所有中国家鸡品种的亲缘关系比泰国红色原鸡Gallus gallus gallus亚种要近．结果表明：29个微卫星位点均具有较高的多态性，红色原鸡和中国家鸡群体间存在着极显著的遗传分化；中国家鸡和红色原鸡两个亚种的亲缘关系从近到远的排序是：进化型品种-原始型品种（茶花鸡与藏鸡）-中国红色原鸡亚种（Gallus gallus spadiceus）-