谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因cDNA全长克隆及序列分析 |
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引用本文: | 李孝霞,谭玉梅,刘永翔,刘作易*.谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因cDNA全长克隆及序列分析[J].基因组学与应用生物学,2013,0(2):185-189. |
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作者姓名: | 李孝霞 谭玉梅 刘永翔 刘作易* |
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作者单位: | 1. 贵州大学,贵阳, 550025 2. 贵州省农业生物技术重点实验室,贵阳, 550006 3. 贵州省生物技术研究所,贵阳, 550006 4. 贵州省农业科学院,贵阳, 550006 |
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摘 要: | 从谢瓦氏曲霉间型变种抑制性差减杂交(SSH)文库中,筛选到一个子囊孢子时期差异表达的序列标签A0128.860,以其序列为模板设计特异性引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆获得了该基因的全长cD-NA,命名为eYchF.生物信息学分析显示,该基因包含一个1182 bp的完整开放阅读框(ORF),编码393个氨基酸,相对分子质量为43.4669 kD,预测的理论等电点为6.99,包括一个保守的G domain (guanine nu-cleotide-binding domain)和一个TGS (ThrRS, GTPase, SpoT) domain,为疏水蛋白.序列同源性分析表明:该基因与棒曲霉(Aspergillus clavatus NRRL 1)的GTP结合蛋白YchF相似度为84%,谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因的克隆及生物信息学分析为YchF的进一步研究奠定了基础.
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关 键 词: | 谢瓦氏曲霉间型变种 YchF基因 RACE |
Cloning and Sequence Analysis of the Full Length YchF cDNA in Asper-gillus chevalieri var. intermedius |
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Abstract: | |
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Keywords: | Aspergillus chevalieri var intermedius YchF gene RACE |
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