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沙地云杉MYB转录因子家族鉴定及其对盐胁迫的响应
作者姓名:隋明明  张富满  田甜  闫艳秋  耿乐  李慧  白玉娥
作者单位:内蒙古农业大学林学院, 内蒙古 呼和浩特 010000
基金项目:国家自然科学基金(32360402);内蒙古自治区自然科学基金(2022MS03037)
摘    要:沙地云杉(Picea mongolica)具有耐寒、耐旱及耐盐的优良特性,是“三北”地区生态建设及城市绿化的重要树种。MYB转录因子可以响应非生物胁迫及次生代谢产物合成过程,为鉴定沙地云杉MYB转录因子家族并探究其在盐胁迫过程中的响应,本研究以挪威云杉基因组及沙地云杉转录组数据为参考,共鉴定出196个MYBs家族成员。根据系统进化树,MYB转录因子家族分为7个亚类,其中,R2R3-MYB亚类基因数量最多,占84.77%,R-R和R1R2R3亚类数量最少,均占0.51%。基序、结构域、基因结构及保守性分析表明,同一亚类MYB转录因子具有高度保守性且具有相似基序和基因结构。不同盐胁迫梯度实验表明,沙地云杉最高的耐受盐胁迫浓度为1 000 mmol/L。在1 000 mmol/L盐胁迫浓度下设置不同处理时间(0、3、6、12、24 h)并测定转录组数据,共筛选出34个MYBs差异表达基因,表明其可能在调控盐胁迫过程中发挥着重要作用。对差异基因编码的蛋白进行理化性质分析发现,蛋白序列长度在89–731 aa,分子量约为10.19–79.73 kDa,等电点为4.80–9.91,不稳定系数41.20–70.99。亚细胞定位显示,大部分蛋白位于细胞核,3个蛋白位于叶绿体中。选取其中12个MYB基因进行实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证,其表达模式与RNA-seq数据一致。本研究为后续探索沙地云杉中MYB家族成员在响应盐胁迫过程的功能及作用机制提供了数据支持。

关 键 词:沙地云杉  MYB转录因子家族  转录组分析  盐胁迫
收稿时间:2024-08-30
修稿时间:2024-12-03
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