| 一种新的RNA二级结构三维图形表示及其应用 |
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| 引用本文： | 刘立伟,刘铁晖.一种新的RNA二级结构三维图形表示及其应用[J].生物信息学,2017,15(1):55-58. |
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| 作者姓名： | 刘立伟 刘铁晖 |
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| 作者单位： | 大连交通大学理学院,辽宁 大连 116028,大连交通大学理学院,辽宁 大连 116028 |
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| 摘 要： | 本研究提出了一种新的RNA二级结构的图形表示方法,这种方法不同于以往的表示方式。根据所提出的RNA二级结构的图形表示,将对9种病毒的RNA二级结构进行图形表示,构建系统进化树,进行序列间相似性的比较和分析。根据最终结果,可以很清晰地发现,AVII与LRMV两种病毒是最为相似的,另外,较大的距离值出现在了APMV与ALMV;PDV与AVII中,这说明这几种RNA二级结构明显不相似。这一研究结果与前人相似性分析的结果是十分相似的,同时,所采取的方法更加简单易于区分观察且得到的结果又是十分可靠的,因此,这些更加证明了该方法是有效的。
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| 关 键 词： | RNA二级结构 图形表示 系统进化树 相似性 |
| 收稿时间： | 2016/8/13 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/9/25 0:00:00 |
A new 3-D graphical representation of RNA secondary structure and its application |
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| LIU Liwei and LIU Tiehui.A new 3-D graphical representation of RNA secondary structure and its application[J].China Journal of Bioinformation,2017,15(1):55-58. |
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| Authors: | LIU Liwei and LIU Tiehui |
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| Institution: | Dalianjiaotong university school of science,Dalian Liaoning 116028, China and Dalianjiaotong university school of science,Dalian Liaoning 116028, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | RNA secondary structure Graphical representation Phylogenetic trees Similarity |
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