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秦巴山区三种人参属药用植物叶绿体基因组特征分析
作者姓名:彭毅丹  马楠  叶奕含  刘亦欣  谭启怡  陈莹  张雨曲  杨新杰
作者单位:1.陕西中医药大学药学院,西安 712046;陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心,"秦药"研发重点实验室,西安 712046;2.陕西中医药大学药学院,西安 712046
基金项目:陕西省科技厅项目(2021SF-360); 中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(2021-I2M-1-032); 陕西省优秀中医药人才研修项目(陕中医药涵 [2022]102号)。
摘    要:为明确珠子参、羽叶三七和秀丽假人参3种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系,该文以秦巴山区3种人参属药用植物为研究对象,运用生物信息学技术,分析其叶绿体基因组特征及密码子使用偏好性,并探讨三者之间的亲缘关系。结果表明:(1)3种人参属药用植物的叶绿体基因组为典型的四分体结构,序列全长为156 071~156 104 bp,总GC含量为38.10%,基因组大小相似度较高。(2)均注释到133个基因,包括88个蛋白编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因。(3)3种人参属药用植物叶绿体密码子使用偏好性相似,密码子第3位碱基以A/U结尾为主,密码子使用模式在受到突变影响的同时,主要受到自然选择的影响。(4)系统发育结果显示,3种人参属药用植物的亲缘关系较近,并且秀丽假人参同羽叶三七亲缘关系更近。综上认为,秀丽假人参与珠子参基源植物之间存在近缘关系,这项发现对于珠子参中药材的资源开发利用和分子鉴定,以及进一步研究人参属物种的分类、系统发育和进化机制提供了重要依据。

关 键 词:珠子参  羽叶三七  秀丽假人参  叶绿体基因组  结构特征  密码子偏好性  
收稿时间:2023-12-29
修稿时间:2024-02-06
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