| 新一代高通量RNA测序数据的处理与分析 |
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| 作者姓名： | 王曦 汪小我 王立坤 冯智星 张学工 |
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| 作者单位： | 生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京 100084;生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京 100084;生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京 100084;吉林大学计算机科学与技术学院,长春 130012;生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京 100084;生物信息学教育部重点实验室,清华信息科学与技术国家实验室(筹)生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京 100084 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(60702002, 60721003, 30873464, 60905013)和东南大学生物电子学国家重点实验室开放研究基金资助项目 |
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| 摘 要： | 随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA-seq)已成为基因表达和转录组分析新的重要手段．RNA-seq技术产生的海量数据为生物信息学带来了新的机遇和挑战．有效地对测序数据进行针对性的生物信息学处理和分析,成为RNA-seq技术能否在科学探索中发挥重大作用的关键．以新一代Illumina/Solexa测序平台所产生的数据为例,在扼要介绍高通量RNA-seq测序流程的基础上,对RNA-seq数据处理和分析的方法和现有软件做一个较为全面的综述,并对其中有待进一步研究的问题进行展望．
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| 关 键 词： | 高通量RNA测序 转录组 基因表达 数据处理与分析 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2010-03-25 |
| 修稿时间： | 2010-04-15 |
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